Balík: dascrubber (1.1-4 a iné)

[ Zdroj: dascrubber  ]

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom dascrubber

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nie alpha, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• sug: daligner

  objavovanie lokálneho zarovnania medzi dlhými čítaniami postupností nukleotidov

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Stiahnuť dascrubber

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.1-4	159.8 kB	1,381.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.1-4	163.9 kB	1,185.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.1-4+b1	155.0 kB	1,534.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.1-4	139.8 kB	1,139.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.1-4	137.6 kB	803.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.1-4	150.4 kB	1,169.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.1-4	157.6 kB	1,327.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.1-4	185.4 kB	2,282.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.1-4	141.1 kB	1,139.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.1-4	135.7 kB	1,217.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.1-4	154.2 kB	1,725.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.1-4	165.7 kB	1,789.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.1-4+b1	166.3 kB	930.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.1-4	155.1 kB	1,237.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.1-4	159.6 kB	999.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.1-4	130.1 kB	1,159.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.1-4	158.9 kB	1,151.0 kB	[zoznam súborov]