Paket: sibelia (3.0.7+dfsg-3 och andra)

Länkar för sibelia

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet sibelia:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [bioinf.spbau.ru]

Liknande paket:

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Andra paket besläktade med sibelia

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: lagan

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

fast suffix array construction
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC stödbibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC stödbibliotek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC stödbibliotek
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

GNU standardbibliotek v3 för C++

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

dep: libstdc++6 (>= 9) [ej arm64, riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

sug: sibelia-examples

comparative genomics tool (example data)

Hämta sibelia

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	3.0.7+dfsg-3	306,8 kbyte	1.318,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	3.0.7+dfsg-3	309,7 kbyte	1.176,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	3.0.7+dfsg-3+b1	292,3 kbyte	1.229,0 kbyte	[filförteckning]
armel	3.0.7+dfsg-3	283,4 kbyte	1.139,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	3.0.7+dfsg-3	289,5 kbyte	955,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	3.0.7+dfsg-3	293,4 kbyte	1.075,0 kbyte	[filförteckning]
i386	3.0.7+dfsg-3	312,3 kbyte	1.151,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	3.0.7+dfsg-3	356,1 kbyte	2.562,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	3.0.7+dfsg-3	311,7 kbyte	1.339,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	3.0.7+dfsg-3	278,1 kbyte	1.250,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	3.0.7+dfsg-3	298,9 kbyte	1.292,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	3.0.7+dfsg-3	305,1 kbyte	1.228,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	3.0.7+dfsg-3+b1	302,4 kbyte	1.069,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	3.0.7+dfsg-3	275,7 kbyte	1.128,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	3.0.7+dfsg-3	339,7 kbyte	1.092,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	3.0.7+dfsg-3	269,2 kbyte	1.128,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	3.0.7+dfsg-3	311,1 kbyte	1.115,0 kbyte	[filförteckning]