套件：sibelia（3.0.7+dfsg-3 以及其他的）

[ 原始碼： sibelia  ]

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

其他與 sibelia 有關的套件

• dep: lagan

  highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支援函式庫

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [除 arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: sibelia-examples

  comparative genomics tool (example data)

下載 sibelia

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	3.0.7+dfsg-3	306。8 kB	1，318。0 kB	[檔案列表]
amd64	3.0.7+dfsg-3	309。7 kB	1，176。0 kB	[檔案列表]
arm64	3.0.7+dfsg-3+b1	292。3 kB	1，229。0 kB	[檔案列表]
armel	3.0.7+dfsg-3	283。4 kB	1，139。0 kB	[檔案列表]
armhf	3.0.7+dfsg-3	289。5 kB	955。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	3.0.7+dfsg-3	293。4 kB	1，075。0 kB	[檔案列表]
i386	3.0.7+dfsg-3	312。3 kB	1，151。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	3.0.7+dfsg-3	356。1 kB	2，562。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	3.0.7+dfsg-3	311。7 kB	1，339。0 kB	[檔案列表]
mips64el	3.0.7+dfsg-3	278。1 kB	1，250。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	3.0.7+dfsg-3	298。9 kB	1，292。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	3.0.7+dfsg-3	305。1 kB	1，228。0 kB	[檔案列表]
riscv64	3.0.7+dfsg-3+b1	302。4 kB	1，069。0 kB	[檔案列表]
s390x	3.0.7+dfsg-3	275。7 kB	1，128。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	3.0.7+dfsg-3	339。7 kB	1，092。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	3.0.7+dfsg-3	269。2 kB	1，128。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	3.0.7+dfsg-3	311。1 kB	1，115。0 kB	[檔案列表]