パッケージ: sibelia (3.0.7+dfsg-3 など)

[ ソース: sibelia  ]

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

その他の sibelia 関連パッケージ

• dep: lagan

  highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [arm64, riscv64 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: sibelia-examples

  comparative genomics tool (example data)

sibelia のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	3.0.7+dfsg-3	306.8 kB	1,318.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	3.0.7+dfsg-3	309.7 kB	1,176.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	3.0.7+dfsg-3+b1	292.3 kB	1,229.0 kB	[ファイル一覧]
armel	3.0.7+dfsg-3	283.4 kB	1,139.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	3.0.7+dfsg-3	289.5 kB	955.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	3.0.7+dfsg-3	293.4 kB	1,075.0 kB	[ファイル一覧]
i386	3.0.7+dfsg-3	312.3 kB	1,151.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	3.0.7+dfsg-3	356.1 kB	2,562.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	3.0.7+dfsg-3	311.7 kB	1,339.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	3.0.7+dfsg-3	278.1 kB	1,250.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	3.0.7+dfsg-3	298.9 kB	1,292.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	3.0.7+dfsg-3	305.1 kB	1,228.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	3.0.7+dfsg-3+b1	302.4 kB	1,069.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	3.0.7+dfsg-3	275.7 kB	1,128.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	3.0.7+dfsg-3	339.7 kB	1,092.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	3.0.7+dfsg-3	269.2 kB	1,128.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	3.0.7+dfsg-3	311.1 kB	1,115.0 kB	[ファイル一覧]