Paket: libbio-db-hts-perl (3.01-5 och andra)

[ Källkod: libbio-db-hts-perl  ]

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Andra paket besläktade med libbio-db-hts-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [ia64]

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

  dep: perl (>= 5.40.0-6) [ej ia64]

• dep: perlapi-5.38.2 [ia64]

  virtuellt paket som tillhandahålls av perl-base

• dep: perlapi-5.40.0 [ej ia64]

  virtuellt paket som tillhandahålls av perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta libbio-db-hts-perl

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	3.01-5	134,8 kbyte	542,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	3.01-5	139,1 kbyte	428,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	3.01-5	133,7 kbyte	477,0 kbyte	[filförteckning]
armel	3.01-5	135,2 kbyte	415,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	3.01-5	134,5 kbyte	375,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	3.01-5	137,3 kbyte	457,0 kbyte	[filförteckning]
i386	3.01-5	140,9 kbyte	447,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	3.01-4+b3	145,4 kbyte	615,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	3.01-5	134,2 kbyte	427,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	3.01-5	129,6 kbyte	548,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	3.01-5	136,9 kbyte	541,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	3.01-5	136,6 kbyte	540,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	3.01-5	139,5 kbyte	403,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	3.01-5	139,3 kbyte	441,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	3.01-5	140,5 kbyte	475,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	3.01-5	131,5 kbyte	2.338,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	3.01-5	139,1 kbyte	423,0 kbyte	[filförteckning]