Pakiet: libbio-db-hts-perl (3.01-5 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libbio-db-hts-perl  ]

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Inne pakiety związane z libbio-db-hts-perl

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [ia64]

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

  dep: perl (>= 5.40.0-6) [nie ia64]

• dep: perlapi-5.38.2 [ia64]

  pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base

• dep: perlapi-5.40.0 [nie ia64]

  pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie libbio-db-hts-perl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.01-5	134,8 KiB	542,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.01-5	139,1 KiB	428,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.01-5	133,7 KiB	477,0 KiB	[lista plików]
armel	3.01-5	135,2 KiB	415,0 KiB	[lista plików]
armhf	3.01-5	134,5 KiB	375,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	3.01-5	137,3 KiB	457,0 KiB	[lista plików]
i386	3.01-5	140,9 KiB	447,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	3.01-4+b3	145,4 KiB	615,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	3.01-5	134,2 KiB	427,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3.01-5	129,6 KiB	548,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.01-5	136,9 KiB	541,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.01-5	136,6 KiB	540,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.01-5	139,5 KiB	403,0 KiB	[lista plików]
s390x	3.01-5	139,3 KiB	441,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	3.01-5	140,5 KiB	475,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	3.01-5	131,5 KiB	2 338,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	3.01-5	139,1 KiB	423,0 KiB	[lista plików]