Paket: abyss (2.1.0-1) [debports]

[ Källkod:  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Andra paket besläktade med abyss

• dep: bsdmainutils

  Transitional package for more utilities from FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.11)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1)

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 shared library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: make

  utility for directing compilation

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• sug: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Hämta abyss

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
hppa (inofficiell anpassning)	2.719,4 kbyte	9.671,0 kbyte	[filförteckning]