Paquet : abyss (2.1.0-1) [debports]

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assembleur de séquences de novo parallèles pour les lectures courtes

ABySS est un assembleur de séquences de novo parallèles conçu pour les lectures courtes. Il peut servir à assembler des données de séquences de génome ou de transcriptome. La parallélisation est permise par MPI, OpenMP et pthread.

Autres paquets associés à abyss

• dep: bsdmainutils

  paquet de transition pour plus d’utilitaires de FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.11)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1)

  Paquet indisponible

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Bibliothèque partagée SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: make

  utilitaire pour mener la compilation

• dep: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• sug: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Télécharger abyss

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
hppa (portage non officiel)	2 719,4 ko	9 671,0 ko	[liste des fichiers]