Paketti: abyss (2.1.0-1) [debports]

[ Source:  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Muut pakettiin abyss liittyvät paketit

• dep: bsdmainutils

  Transitional package for more utilities from FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.11)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1)

  Paketti ei saatavilla

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 (jaettu kirjasto)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: make

  utility for directing compilation

• dep: perl

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• sug: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Imuroi abyss

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
hppa (epävirallinen siirros)	2,719.4 kt	9,671.0 kt	[tiedostoluettelo]