Pakiet: abyss (2.1.0-1) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Nowy, równoległy, sekwencyjny asembler do krótkich odczytów

ABySS jest nowym, równoległym asemblerem sekwencji, przeznaczonym do krótkich odczytów. Może być używany do złożenia danych genomu lub transkryptomeksji. Równoległość osiągana jest za pomocą: MPI, OpenMP i pthread.

Inne pakiety związane z abyss

• dep: bsdmainutils

  Pakiet przejściowy instalujący więcej narzędzi z FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.11)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1)

  Pakiet niedostępny

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: make

  Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• sug: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Pobieranie abyss

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
hppa (port nieoficjalny)	2 719,4 KiB	9 671,0 KiB	[lista plików]