Paket: delly (1.1.8-1 och andra)

[ Källkod: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Andra paket besläktade med delly

• dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  set of date-time libraries based on generic programming concepts

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams Library

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Operating system (e.g. diagnostics support) library

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  XZ-format compression library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ej arm64, x32]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta delly

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.1.8-1+b3	367,2 kbyte	1.368,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.1.8-1+b2	394,0 kbyte	1.200,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.1.8-1+b3	355,5 kbyte	1.172,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.1.8-1+b2	318,5 kbyte	1.027,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.1.8-1+b2	329,8 kbyte	723,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.1.8-1+b2	379,8 kbyte	1.124,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.1.8-1+b2	419,1 kbyte	1.251,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.1.8-1+b2	506,4 kbyte	2.499,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.1.8-1+b2	370,6 kbyte	1.171,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.1.8-1+b2	354,5 kbyte	1.474,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.1.8-1+b2	387,6 kbyte	1.492,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.1.8-1+b2	386,6 kbyte	1.364,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.1.8-1+b2	382,7 kbyte	884,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.1.8-1+b2	399,0 kbyte	1.280,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.1.8-1+b2	468,4 kbyte	1.109,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.1.8-1+b2	323,6 kbyte	2.077,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.1.8-1+b3	412,7 kbyte	1.195,0 kbyte	[filförteckning]