Paket: delly (0.8.7-1)

[ Källkod: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Andra paket besläktade med delly

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Boost.Iostreams Library

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta delly

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	317,4 kbyte	1.030,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	279,0 kbyte	938,0 kbyte	[filförteckning]
armel	251,9 kbyte	864,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	263,5 kbyte	616,0 kbyte	[filförteckning]
i386	337,7 kbyte	1.068,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	299,2 kbyte	1.255,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	299,5 kbyte	1.213,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	320,3 kbyte	1.238,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	288,1 kbyte	1.074,0 kbyte	[filförteckning]