Paket: delly (1.1.6-1)

[ Källkod: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Andra paket besläktade med delly

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Boost.Iostreams Library

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta delly

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	321,3 kbyte	987,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	277,9 kbyte	915,0 kbyte	[filförteckning]
armel	258,1 kbyte	850,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	266,4 kbyte	594,0 kbyte	[filförteckning]
i386	338,6 kbyte	1.042,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	293,6 kbyte	1.207,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	296,6 kbyte	1.203,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	320,5 kbyte	1.171,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	291,7 kbyte	1.027,0 kbyte	[filförteckning]