Paquet : delly (1.1.8-1 et autres)

[ Paquet source : delly  ]

découverte de variantes structurelles par analyse des lectures

Delly est une méthode de prédiction de variantes structurelles (SV) intégrée qui peut découvrir, génotyper et visualiser des délétions, des duplications en tandem, des inversions et des translocations à une résolution mononucléotidique dans des données de séquençage massivement parallèles à lecture courte et longue. Il utilise des extrémités appariées, des lectures fractionnées et une profondeur de lecture pour délimiter avec sensibilité et précision les réarrangements génomiques dans tout le génome.

Autres paquets associés à delly

• dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  ensemble de bibliothèques de date et d'horaire basées sur les concepts génériques de programmation

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliothèque Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliothèque d'options de programmes pour C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  bibliothèque de système d'exploitation (par ex. gestion des diagnostics)

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, loong64, mips64el, ppc64, riscv64, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  librairie de compression au format XZ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non arm64, x32]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  Bibliothèque de compression - binaires

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Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.1.8-1+b3	367,2 ko	1 368,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.1.8-1+b2	394,0 ko	1 200,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.1.8-1+b3	355,5 ko	1 172,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.1.8-1+b2	318,5 ko	1 027,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.1.8-1+b2	329,8 ko	723,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.1.8-1+b2	379,8 ko	1 124,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.1.8-1+b2	419,1 ko	1 251,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.1.8-1+b2	506,4 ko	2 499,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.1.8-1+b2	354,3 ko	1 143,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.1.8-1+b2	370,6 ko	1 171,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.1.8-1+b2	354,5 ko	1 474,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.1.8-1+b2	387,6 ko	1 492,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.1.8-1+b2	386,6 ko	1 364,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.1.8-1+b2	382,7 ko	884,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.1.8-1+b2	399,0 ko	1 280,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.1.8-1+b2	468,4 ko	1 109,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.1.8-1+b2	323,6 ko	2 077,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.1.8-1+b3	412,7 ko	1 195,0 ko	[liste des fichiers]