Пакет: delly (1.1.8-1 и другие)

[ Источник: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Другие пакеты, относящиеся к delly

• dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  set of date-time libraries based on generic programming concepts

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  библиотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Operating system (e.g. diagnostics support) library

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  библиотека для работы с архивами в формате XZ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не arm64, x32]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  библиотека сжатия

Загрузка delly

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.1.8-1+b3	367,2 Кб	1 368,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.1.8-1+b2	394,0 Кб	1 200,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.1.8-1+b3	355,5 Кб	1 172,0 Кб	[список файлов]
armel	1.1.8-1+b2	318,5 Кб	1 027,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.1.8-1+b2	329,8 Кб	723,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.1.8-1+b2	379,8 Кб	1 124,0 Кб	[список файлов]
i386	1.1.8-1+b2	419,1 Кб	1 251,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.1.8-1+b2	506,4 Кб	2 499,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.1.8-1+b2	370,6 Кб	1 171,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.1.8-1+b2	354,5 Кб	1 474,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.1.8-1+b2	387,6 Кб	1 492,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.1.8-1+b2	386,6 Кб	1 364,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.1.8-1+b2	382,7 Кб	884,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.1.8-1+b2	399,0 Кб	1 280,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.1.8-1+b2	468,4 Кб	1 109,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.1.8-1+b2	323,6 Кб	2 077,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.1.8-1+b3	412,7 Кб	1 195,0 Кб	[список файлов]