Paket: blasr (5.3.5+dfsg-7 och andra)

[ Källkod: blasr  ]

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Andra paket besläktade med blasr

• dep: libblasr [x32]

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg) [ej hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [hppa, ppc64]

  dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [x32]

  Paketet inte tillgängligt

  dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sh4]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libhdf5-10 [hppa, ppc64]

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libhdf5-100 [x32]

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0) [x32]

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libhdf5-cpp-103 (>= 1.10.1) [m68k, sh4]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version (transitional package)

• dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5) [ia64]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.15-patch1) [ppc64]

  Paketet inte tillgängligt

  dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.16) [hppa]

• dep: libhdf5-cpp-310 (>= 1.14.4.3) [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libpbbam0.23.0 (>= 0.23.0+dfsg) [m68k, sh4]

  Paketet inte tillgängligt

• dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg) [ej hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [ej hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbdata [x32]

  tools for handling PacBio sequences

• dep: libpbihdf [x32]

  tools for handling PacBio hdf5 files

• dep: libpbseq [m68k, sh4]

  library for analyzing PacBio sequencing data

  dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~) [ia64]

  dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-9~) [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ej hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [hppa, ppc64, x32]

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta blasr

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	5.3.5+dfsg-7+b1	226,4 kbyte	808,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	5.3.5+dfsg-7+b1	232,8 kbyte	700,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	5.3.5+dfsg-7+b1	201,7 kbyte	680,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1.423,6 kbyte	6.078,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	5.3.5+dfsg-6+b4	271,0 kbyte	1.226,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	5.3.3+dfsg-1+b1	180,6 kbyte	591,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	5.3.5+dfsg-7+b1	214,9 kbyte	824,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1.367,5 kbyte	6.824,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	5.3.5+dfsg-7+b1	226,1 kbyte	808,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	5.3.5+dfsg-7+b1	226,1 kbyte	532,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	5.3.3+dfsg-1+b1	223,0 kbyte	543,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	5.3-1+b1	459,5 kbyte	1.607,0 kbyte	[filförteckning]