Paket: blasr (5.3.5+dfsg-6)

[ Källkod: blasr  ]

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Andra paket besläktade med blasr

• dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg)

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC stödbibliotek

• dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5)

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libpbbam2.1.0 (>= 2.1.0+dfsg)

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper2.0.0 (>= 2.0.0+dfsg)

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~)

  library for analyzing PacBio sequencing data

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta blasr

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	217,5 kbyte	652,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	190,2 kbyte	616,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	199,8 kbyte	759,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	216,6 kbyte	744,0 kbyte	[filförteckning]