Paketti: blasr (5.3.5+dfsg-7 ja muut)

[ Source: blasr  ]

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Muut pakettiin blasr liittyvät paketit

• dep: libblasr [x32]

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [hppa, ppc64]

  dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [x32]

  Paketti ei saatavilla

  dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sh4]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libhdf5-10 [hppa, ppc64]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libhdf5-100 [x32]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0) [x32]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libhdf5-cpp-103 (>= 1.10.1) [m68k, sh4]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version (transitional package)

• dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5) [ia64]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.15-patch1) [ppc64]

  Paketti ei saatavilla

  dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.16) [hppa]

• dep: libhdf5-cpp-310 (>= 1.14.4.3) [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libpbbam0.23.0 (>= 0.23.0+dfsg) [m68k, sh4]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbdata [x32]

  tools for handling PacBio sequences

• dep: libpbihdf [x32]

  tools for handling PacBio hdf5 files

• dep: libpbseq [m68k, sh4]

  library for analyzing PacBio sequencing data

  dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~) [ia64]

  dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-9~) [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [hppa, ppc64, x32]

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi blasr

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	5.3.5+dfsg-7+b1	226.4 kt	808.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	5.3.5+dfsg-7+b1	232.8 kt	700.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	5.3.5+dfsg-7+b1	201.7 kt	680.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1,423.6 kt	6,078.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	5.3.5+dfsg-6+b4	271.0 kt	1,226.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	5.3.3+dfsg-1+b1	180.6 kt	591.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	5.3.5+dfsg-7+b1	214.9 kt	824.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1,367.5 kt	6,824.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	5.3.5+dfsg-7+b1	226.1 kt	808.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	5.3.5+dfsg-7+b1	226.1 kt	532.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	5.3.3+dfsg-1+b1	223.0 kt	543.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	5.3-1+b1	459.5 kt	1,607.0 kt	[tiedostoluettelo]