Package: tantan (40-1)

[ Source: tantan  ]

mascheratore di complessità bassa e ripetizioni tandem per biosequenze

tantan è uno strumento per mascherare regioni semplici (a bassa complessità e con ripetizioni tandem a periodo breve) in sequenze di DNA, RNA e proteiche. Lo scopo di tantan è di evitare predizioni false quando si cercano regioni omologhe tra due sequenze. Le ripetizioni semplici spesso danno allineamenti robusti tra di loro, causando false predizioni di omologia.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to tantan

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download tantan

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	39.3 kB	112.0 kB	[list of files]
arm64	36.1 kB	144.0 kB	[list of files]
armel	35.7 kB	143.0 kB	[list of files]
armhf	33.8 kB	79.0 kB	[list of files]
i386	41.9 kB	119.0 kB	[list of files]
mips64el	40.6 kB	150.0 kB	[list of files]
mipsel	41.0 kB	148.0 kB	[list of files]
ppc64el	42.9 kB	144.0 kB	[list of files]
s390x	37.5 kB	116.0 kB	[list of files]