Paketti: tantan (40-1)

[ Source: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with::biological-sequence

Muut pakettiin tantan liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi tantan

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	39.3 kt	112.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	36.1 kt	144.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	35.7 kt	143.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	33.8 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	41.9 kt	119.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	40.6 kt	150.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	41.0 kt	148.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	42.9 kt	144.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	37.5 kt	116.0 kt	[tiedostoluettelo]