Package: abyss (2.1.5-7)

[ Source: abyss  ]

De novo, parallel, sekvensassembler for korte læsninger

ABySS er en de nove, parallel, sekvensassembler, som er designet for korte læsninger. Den kan bruges til at samle genom eller transkriptome sekvensdata. Parallelisering opnås via MPI, OpenMP og pthread.

Tags: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Other Packages Related to abyss

• dep: bsdmainutils

  Værktøjssamling fra FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.28) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libopenmpi3

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Delt bibliotek til SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: make

  Redskab til at dirigere kompileringen

• dep: openmpi-bin

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - binære filer

• dep: openmpi-common

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - fælles filer

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

Download abyss

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,885.5 kB	8,774.0 kB	[list of files]
arm64	2,716.8 kB	8,114.0 kB	[list of files]
armhf	2,724.5 kB	6,470.0 kB	[list of files]
i386	2,960.8 kB	9,334.0 kB	[list of files]