Пакет: examl (3.0.22-5)

[ Источник: examl  ]

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) code for phylogenetic inference

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) is a code for phylogenetic inference using MPI. This code implements the popular RAxML search algorithm for maximum likelihood based inference of phylogenetic trees.

ExaML is a strapped-down light-weight version of RAxML for phylogenetic inference on huge datasets. It can only execute some very basic functions and is intended for computer-savvy users that can write little perl-scripts and have experience using queue submission scripts for clusters. ExaML only implements the CAT and GAMMA models of rate heterogeneity for binary, DNA, and protein data.

ExaML uses a radically new MPI parallelization approach that yields improved parallel efficiency, in particular on partitioned multi-gene or whole-genome datasets. It also implements a new load balancing algorithm that yields better parallel efficiency.

It is up to 4 times faster than its predecessor RAxML-Light and scales to a larger number of processors.

Другие пакеты, относящиеся к examl

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Загрузка examl

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	931,6 Кб	5 969,0 Кб	[список файлов]
arm64	780,5 Кб	1 663,0 Кб	[список файлов]
armel	796,9 Кб	1 872,0 Кб	[список файлов]
armhf	785,1 Кб	1 520,0 Кб	[список файлов]
i386	1 078,8 Кб	7 035,0 Кб	[список файлов]
mips64el	816,6 Кб	1 811,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	845,9 Кб	1 919,0 Кб	[список файлов]
s390x	818,0 Кб	1 995,0 Кб	[список файлов]