Пакет: examl (3.0.22-6 и другие)

[ Источник: examl  ]

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) code for phylogenetic inference

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) is a code for phylogenetic inference using MPI. This code implements the popular RAxML search algorithm for maximum likelihood based inference of phylogenetic trees.

ExaML is a strapped-down light-weight version of RAxML for phylogenetic inference on huge datasets. It can only execute some very basic functions and is intended for computer-savvy users that can write little perl-scripts and have experience using queue submission scripts for clusters. ExaML only implements the CAT and GAMMA models of rate heterogeneity for binary, DNA, and protein data.

ExaML uses a radically new MPI parallelization approach that yields improved parallel efficiency, in particular on partitioned multi-gene or whole-genome datasets. It also implements a new load balancing algorithm that yields better parallel efficiency.

It is up to 4 times faster than its predecessor RAxML-Light and scales to a larger number of processors.

Другие пакеты, относящиеся к examl

• dep: libc6 (>= 2.38)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libmpich12 [armel, armhf, i386]

  Shared libraries for MPICH

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [не armel, armhf, i386]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: mpi-default-bin

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

Загрузка examl

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3.0.22-6+b2	937,8 Кб	6 019,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.0.22-6+b2	778,7 Кб	1 665,0 Кб	[список файлов]
armel	3.0.22-6+b1	797,3 Кб	2 046,0 Кб	[список файлов]
armhf	3.0.22-6+b1	786,3 Кб	1 598,0 Кб	[список файлов]
i386	3.0.22-6+b1	1 078,9 Кб	7 013,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3.0.22-6+b2	818,6 Кб	1 813,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3.0.22-6+b2	837,7 Кб	1 793,0 Кб	[список файлов]
riscv64	3.0.22-6+b2	835,6 Кб	1 577,0 Кб	[список файлов]
s390x	3.0.22-6+b2	826,1 Кб	2 061,0 Кб	[список файлов]