Пакет: concavity (0.1+dfsg.1-6)

[ Источник: concavity  ]

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

Другие пакеты, относящиеся к concavity

• dep: libc6 (>= 2.38)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• sug: conservation-code

  protein sequence conservation scoring tool

• sug: pymol

  Пакет недоступен

Загрузка concavity

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	238,3 Кб	967,0 Кб	[список файлов]
arm64	229,2 Кб	1 000,0 Кб	[список файлов]
armel	223,8 Кб	939,0 Кб	[список файлов]
armhf	216,8 Кб	815,0 Кб	[список файлов]
i386	249,8 Кб	1 006,0 Кб	[список файлов]
mips64el	254,4 Кб	1 179,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	251,4 Кб	1 128,0 Кб	[список файлов]
riscv64	243,8 Кб	883,0 Кб	[список файлов]
s390x	240,8 Кб	979,0 Кб	[список файлов]