Пакет: r-bioc-oligo (1.70.0+ds-2 и другие)

[ Источник: r-bioc-oligo  ]

Preprocessing tools for oligonucleotide arrays

A package to analyze oligonucleotide arrays (expression/SNP/tiling/exon) at probe-level. It currently supports Affymetrix (CEL files) and NimbleGen arrays (XYS files).

Другие пакеты, относящиеся к r-bioc-oligo

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [не alpha, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-4.0

  виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4, x32]

  Пакет недоступен

• dep: r-api-bioc-3.20 [не hppa, ia64, sh4, x32]

  виртуальный пакет, предоставляемый r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-affxparser (>= 1.39.4)

  Affymetrix File Parsing SDK

• dep: r-bioc-affyio (>= 1.35.0)

  BioConductor tools for parsing Affymetrix data files

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.27.3)

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.11)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.35.12)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.29.6)

  Classes for high-throughput arrays supported by oligo and crlmm

• dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.29.0)

  BioConductor collection of pre-processing functions

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

  GNU R package providing a generic database interface

• dep: r-cran-ff

  Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data

• dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

  Database Interface R driver for SQLite

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biomart

  GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)

• sug: r-bioc-genefilter

  methods for filtering genes from microarray experiments

• sug: r-bioc-limma

  linear models for microarray data

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R package providing suitable color palettes

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Загрузка r-bioc-oligo

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.70.0+ds-2	897,9 Кб	1 353,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.70.0+ds-2	898,7 Кб	1 345,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.70.0+ds-2	897,4 Кб	1 353,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.66.0+ds-1	907,4 Кб	1 348,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.66.0+ds-1	910,9 Кб	1 381,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	1.70.0+ds-2	898,4 Кб	1 353,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.70.0+ds-2	897,0 Кб	1 356,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.70.0+ds-2	901,6 Кб	1 418,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.70.0+ds-2	900,5 Кб	1 353,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.70.0+ds-2	898,0 Кб	1 329,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.70.0+ds-2	899,3 Кб	1 341,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.66.0+ds-1	907,4 Кб	1 354,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.70.0+ds-2	895,6 Кб	2 315,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.66.0+ds-1	907,2 Кб	1 338,0 Кб	[список файлов]