Paquet : r-bioc-oligo (1.70.0+ds-2 et autres)

[ Paquet source : r-bioc-oligo  ]

Preprocessing tools for oligonucleotide arrays

A package to analyze oligonucleotide arrays (expression/SNP/tiling/exon) at probe-level. It currently supports Affymetrix (CEL files) and NimbleGen arrays (XYS files).

Autres paquets associés à r-bioc-oligo

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [non alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4, x32]

  Paquet indisponible

• dep: r-api-bioc-3.20 [non hppa, ia64, sh4, x32]

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-affxparser (>= 1.39.4)

  kit de développement logiciel d'analyse de fichiers Affymetrix

• dep: r-bioc-affyio (>= 1.35.0)

  outils BioConductor pour l'analyse de fichiers de données d'Affymetrix

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.27.3)

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.11)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.35.12)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.29.6)

  classes pour des tableaux de grande capacité gérés par oligo et crlmm

• dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.29.0)

  collection de fonctions de prétraitement de BioConductor

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

  paquet de GNU R fournissant une interface généraliste de base de données

• dep: r-cran-ff

  Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data

• dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

  Database Interface R driver for SQLite

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biomart

  interface de GNU R aux bases de données BioMart (Ensembl, COSMIC, Wormbase et Gramene)

• sug: r-bioc-genefilter

  méthodes de filtrage de gènes à partir d’expériences sur puce

• sug: r-bioc-limma

  modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

Télécharger r-bioc-oligo

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.70.0+ds-2	897,9 ko	1 353,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.70.0+ds-2	898,7 ko	1 345,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.70.0+ds-2	897,4 ko	1 353,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.66.0+ds-1	907,4 ko	1 348,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.66.0+ds-1	910,9 ko	1 381,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.70.0+ds-2	897,0 ko	1 356,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.70.0+ds-2	901,6 ko	1 418,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.70.0+ds-2	900,5 ko	1 353,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.70.0+ds-2	898,0 ko	1 329,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.70.0+ds-2	899,3 ko	1 341,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.66.0+ds-1	907,4 ko	1 354,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.70.0+ds-2	895,6 ko	2 315,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.66.0+ds-1	907,2 ko	1 338,0 ko	[liste des fichiers]