Pakiet: r-bioc-oligo (1.68.2+ds-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-oligo  ]

Preprocessing tools for oligonucleotide arrays

A package to analyze oligonucleotide arrays (expression/SNP/tiling/exon) at probe-level. It currently supports Affymetrix (CEL files) and NimbleGen arrays (XYS files).

Inne pakiety związane z r-bioc-oligo

• dep: libblas3 [sparc64]

  Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [nie alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: liblapack3 [sparc64]

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  lub liblapack.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4, x32]

  Pakiet niedostępny

• dep: r-api-bioc-3.19 [nie hppa, ia64, sh4, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-affxparser (>= 1.39.4) [hppa, ia64, sh4, x32]

  Affymetrix File Parsing SDK

  dep: r-bioc-affxparser (>= 1.76.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-affyio (>= 1.35.0) [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor tools for parsing Affymetrix data files

  dep: r-bioc-affyio (>= 1.74.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.27.3) [hppa, ia64, sh4, x32]

  base functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.11) [hppa, ia64, sh4, x32]

  generic functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.35.12) [hppa, ia64, sh4, x32]

  GNU R string objects representing biological sequences

  dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.29.6) [hppa, ia64, sh4, x32]

  Classes for high-throughput arrays supported by oligo and crlmm

  dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.66.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.29.0) [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor collection of pre-processing functions

  dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.66.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-bioc-zlibbioc [hppa, ia64, sh4, x32]

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

  dep: r-bioc-zlibbioc (>= 1.50.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

  GNU R package providing a generic database interface

• dep: r-cran-ff

  Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data

• dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

  Database Interface R driver for SQLite

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: r-bioc-annotationdbi [hppa, ia64, sh4, x32]

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

  sug: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• sug: r-bioc-biocstyle [hppa, ia64, sh4, x32]

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

  sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• sug: r-bioc-biomart [hppa, ia64, sh4, x32]

  GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)

  sug: r-bioc-biomart (>= 2.60.1) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• sug: r-bioc-genefilter [hppa, ia64, sh4, x32]

  methods for filtering genes from microarray experiments

  sug: r-bioc-genefilter (>= 1.86.0) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• sug: r-bioc-limma [hppa, ia64, sh4, x32]

  linear models for microarray data

  sug: r-bioc-limma (>= 3.60.3) [nie hppa, ia64, sh4, x32]

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R package providing suitable color palettes

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Pobieranie r-bioc-oligo

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.68.2+ds-1	897,9 KiB	1 352,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.68.2+ds-1	898,9 KiB	1 344,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.68.2+ds-1	897,7 KiB	1 352,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.66.0+ds-1	907,4 KiB	1 348,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.66.0+ds-1	910,9 KiB	1 381,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.68.2+ds-1	897,3 KiB	1 355,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.68.2+ds-1	901,4 KiB	1 417,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.68.2+ds-1	900,8 KiB	1 352,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.68.2+ds-1	898,3 KiB	1 328,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.68.2+ds-1	899,6 KiB	1 340,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.66.0+ds-1	907,4 KiB	1 354,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.68.2+ds-1	895,0 KiB	2 314,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.66.0+ds-1	907,2 KiB	1 338,0 KiB	[lista plików]