Пакет: density-fitness (1.0.12-2 и другие)

[ Источник: density-fitness  ]

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

Другие пакеты, относящиеся к density-fitness

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  библиотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, hppa, ia64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libcifpp1 (>= 1.0.1) [hppa]

  Пакет недоступен

• dep: libcifpp5 (>= 5.0.7.1) [alpha, ia64, x32]

  Library files for libcifpp

• dep: libcifpp7 (>= 7.0.7) [не alpha, hppa, ia64, x32]

  Library files for libcifpp

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libpdb-redo1 (>= 1.0.2-3~) [hppa]

  Пакет недоступен

• dep: libpdb-redo3 (>= 3.0.5) [alpha, ia64, x32]

  Library file for libpdb-redo

  dep: libpdb-redo3 (>= 3.1.5) [не alpha, hppa, ia64, x32]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [alpha, hppa, ia64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не alpha, hppa, ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: libzeep5.1 (>= 5.1.4) [hppa]

  Library file for libzeep

  dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8) [не hppa]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.2) [alpha, ia64, x32]

  библиотека сжатия

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [не alpha, hppa, ia64, x32]

Загрузка density-fitness

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.0.8-4	447,6 Кб	5 608,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.0.12-2	482,4 Кб	5 862,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.0.12-2	476,9 Кб	5 910,0 Кб	[список файлов]
armel	1.0.12-2	475,7 Кб	5 841,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.0.12-2	475,7 Кб	5 813,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.0.0-4	104,9 Кб	359,0 Кб	[список файлов]
i386	1.0.12-2	485,6 Кб	5 865,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.0.8-4	461,7 Кб	5 675,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.0.12-2	475,3 Кб	5 845,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.0.12-2	480,7 Кб	5 918,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.0.12-2	483,0 Кб	5 912,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.0.12-2	482,5 Кб	5 910,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.0.12-2	481,0 Кб	5 834,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.0.12-2	481,1 Кб	5 866,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.0.12-2	482,1 Кб	5 845,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.0.12-2	476,4 Кб	6 746,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.0.8-4+b1	477,6 Кб	5 843,0 Кб	[список файлов]