Пакет: density-fitness (1.0.12-2)

[ Источник: density-fitness  ]

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

Другие пакеты, относящиеся к density-fitness

• dep: libc6 (>= 2.38)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libcifpp7 (>= 7.0.7)

  Library files for libcifpp

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libpdb-redo3 (>= 3.1.5)

  Library file for libpdb-redo

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8)

  Library file for libzeep

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  библиотека сжатия

Загрузка density-fitness

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	482,4 Кб	5 862,0 Кб	[список файлов]
arm64	476,9 Кб	5 910,0 Кб	[список файлов]
armel	475,7 Кб	5 841,0 Кб	[список файлов]
armhf	475,7 Кб	5 813,0 Кб	[список файлов]
i386	485,6 Кб	5 865,0 Кб	[список файлов]
mips64el	480,7 Кб	5 918,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	482,5 Кб	5 910,0 Кб	[список файлов]
riscv64	481,0 Кб	5 834,0 Кб	[список файлов]
s390x	481,1 Кб	5 866,0 Кб	[список файлов]