Paketti: density-fitness (1.0.12-2 ja muut)

[ Source: density-fitness  ]

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

Muut pakettiin density-fitness liittyvät paketit

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  Boost.Iostreams -kirjasto

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, hppa, ia64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcifpp1 (>= 1.0.1) [hppa]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libcifpp5 (>= 5.0.7.1) [ia64, x32]

  Library files for libcifpp

• dep: libcifpp7 (>= 7.0.7) [ei hppa, ia64, x32]

  Library files for libcifpp

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libpdb-redo1 (>= 1.0.2-3~) [hppa]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libpdb-redo3 (>= 3.0.5) [ia64, x32]

  Library file for libpdb-redo

  dep: libpdb-redo3 (>= 3.1.5) [ei hppa, ia64, x32]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa, ia64]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei hppa, ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libzeep5.1 (>= 5.1.4) [hppa]

  Library file for libzeep

  dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8) [ei hppa]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.2) [ia64, x32]

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [ei hppa, ia64, x32]

Imuroi density-fitness

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.0.12-2	479.1 kt	5,911.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.0.12-2	482.4 kt	5,862.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.0.12-2	476.9 kt	5,910.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.0.12-2	475.7 kt	5,841.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.0.12-2	475.7 kt	5,813.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.0.0-4	104.9 kt	359.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.0.12-2	485.6 kt	5,865.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.0.8-4	461.7 kt	5,675.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.0.12-2	475.3 kt	5,845.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.0.12-2	480.7 kt	5,918.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.0.12-2	483.0 kt	5,912.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.0.12-2	482.5 kt	5,910.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.0.12-2	481.0 kt	5,834.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.0.12-2	481.1 kt	5,866.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.0.12-2	482.1 kt	5,845.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.0.12-2	476.4 kt	6,746.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.0.8-4+b1	477.6 kt	5,843.0 kt	[tiedostoluettelo]