Pakiet: density-fitness (1.0.12-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: density-fitness  ]

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

Inne pakiety związane z density-fitness

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, hppa, ia64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcifpp1 (>= 1.0.1) [hppa]

  Pakiet niedostępny

• dep: libcifpp5 (>= 5.0.7.1) [ia64, x32]

  Library files for libcifpp

• dep: libcifpp7 (>= 7.0.7) [nie hppa, ia64, x32]

  Library files for libcifpp

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libpdb-redo1 (>= 1.0.2-3~) [hppa]

  Pakiet niedostępny

• dep: libpdb-redo3 (>= 3.0.5) [ia64, x32]

  Library file for libpdb-redo

  dep: libpdb-redo3 (>= 3.1.5) [nie hppa, ia64, x32]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa, ia64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie hppa, ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: libzeep5.1 (>= 5.1.4) [hppa]

  Library file for libzeep

  dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8) [nie hppa]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.2) [ia64, x32]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [nie hppa, ia64, x32]

Pobieranie density-fitness

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.12-2	479,1 KiB	5 911,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.12-2	482,4 KiB	5 862,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.12-2	476,9 KiB	5 910,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.12-2	475,7 KiB	5 841,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.12-2	475,7 KiB	5 813,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.0-4	104,9 KiB	359,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.12-2	485,6 KiB	5 865,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.8-4	461,7 KiB	5 675,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.12-2	475,3 KiB	5 845,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.12-2	480,7 KiB	5 918,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.12-2	483,0 KiB	5 912,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.12-2	482,5 KiB	5 910,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.12-2	481,0 KiB	5 834,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.12-2	481,1 KiB	5 866,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.12-2	482,1 KiB	5 845,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.12-2	476,4 KiB	6 746,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.8-4+b1	477,6 KiB	5 843,0 KiB	[lista plików]