Pacote: libssw0 (1.1-15 e outros)

[ Fonte: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Etiquetas: Função: Biblioteca compartilhada

Outros pacotes relacionados a libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [não amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [não armel, armhf]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: zlib1g

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de libssw0

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	1.1-15+b2	21.3 kB	64.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.1-15+b2	19.6 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.1-15+b2	20.9 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.1-15+b2	21.2 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.1-15+b2	26.1 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.1-15+b2	25.5 kB	86.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.1-15+b2	22.3 kB	84.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.1-15+b2	25.3 kB	60.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.1-15+b2	25.5 kB	68.0 kB	[lista de arquivos]