Pacote: libssw0 (1.1-13)

[ Fonte: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Etiquetas: Função: Biblioteca compartilhada

Outros pacotes relacionados a libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [não amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: zlib1g

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de libssw0

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	19.2 kB	55.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	18.1 kB	51.0 kB	[lista de arquivos]
armel	20.5 kB	59.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	20.7 kB	51.0 kB	[lista de arquivos]
i386	26.5 kB	83.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	26.1 kB	77.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	25.7 kB	72.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	19.4 kB	83.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	23.2 kB	71.0 kB	[lista de arquivos]