Pacote: velvet-long (1.2.10+dfsg1-9 e outros)

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Recursos de Debian:

Baixe o pacote-fonte velvet:

Mantenedores(as):

Fontes externas:

Pagina principal [github.com]

Pacotes similares:

Nucleic acid sequence assembler for very short reads, long version

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

This package installs special long-mode versions of Velvet, as recommended in the Velvet tutorials.

Outros pacotes relacionados a velvet-long

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.39) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)
dep: velvet

Nucleic acid sequence assembler for very short reads
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [não armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Download de velvet-long

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	245.2 kB	2,955.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.2.10+dfsg1-9	192.2 kB	1,860.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.2.10+dfsg1-9	194.5 kB	2,320.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.2.10+dfsg1-9	221.0 kB	2,126.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.2.10+dfsg1-9	199.7 kB	1,306.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	250.2 kB	2,422.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.2.10+dfsg1-9	227.8 kB	2,365.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-8	328.5 kB	5,411.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	196.5 kB	1,910.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	180.7 kB	1,700.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.2.10+dfsg1-9	198.2 kB	2,632.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	211.5 kB	2,650.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.2.10+dfsg1-9	221.6 kB	2,635.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.2.10+dfsg1-9	274.2 kB	2,032.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.2.10+dfsg1-9	210.7 kB	2,030.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	222.1 kB	2,300.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	212.2 kB	10,340.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.2.10+dfsg1-9	208.3 kB	1,842.0 kB	[lista de arquivos]