Пакет: velvet-long (1.2.10+dfsg1-9 и други)

[ Източник: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads, long version

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

This package installs special long-mode versions of Velvet, as recommended in the Velvet tutorials.

Други пакети, свързани с velvet-long

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: velvet

  Nucleic acid sequence assembler for very short reads

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [не armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  compression library - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Изтегляне на velvet-long

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.2.10+dfsg1-9	245,2 кБ	2 955,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.2.10+dfsg1-9	192,2 кБ	1 860,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.2.10+dfsg1-9	194,5 кБ	2 320,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.2.10+dfsg1-9	221,0 кБ	2 126,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.2.10+dfsg1-9	199,7 кБ	1 306,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.2.10+dfsg1-9	250,2 кБ	2 422,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.2.10+dfsg1-9	227,8 кБ	2 365,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.2.10+dfsg1-8	328,5 кБ	5 411,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.2.10+dfsg1-9	180,7 кБ	1 700,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.2.10+dfsg1-9	198,2 кБ	2 632,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.2.10+dfsg1-9	211,5 кБ	2 650,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.2.10+dfsg1-9	221,6 кБ	2 635,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.2.10+dfsg1-9	274,2 кБ	2 032,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.2.10+dfsg1-9	210,7 кБ	2 030,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.2.10+dfsg1-9	222,1 кБ	2 300,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.2.10+dfsg1-9	212,2 кБ	10 340,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.2.10+dfsg1-9	208,3 кБ	1 842,0 кБ	[списък на файловете]