Balík: velvet-long (1.2.10+dfsg1-9 a iné)

[ Zdroj: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads, long version

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

This package installs special long-mode versions of Velvet, as recommended in the Velvet tutorials.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom velvet-long

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: velvet

  Nucleic acid sequence assembler for very short reads

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Stiahnuť velvet-long

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.2.10+dfsg1-9	245.2 kB	2,955.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.2.10+dfsg1-9	192.2 kB	1,860.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.2.10+dfsg1-9	194.5 kB	2,320.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.2.10+dfsg1-9	221.0 kB	2,126.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.2.10+dfsg1-9	199.7 kB	1,306.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.2.10+dfsg1-9	250.2 kB	2,422.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.2.10+dfsg1-9	227.8 kB	2,365.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.2.10+dfsg1-8	328.5 kB	5,411.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.2.10+dfsg1-9	180.7 kB	1,700.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.2.10+dfsg1-9	198.2 kB	2,632.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.2.10+dfsg1-9	211.5 kB	2,650.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.2.10+dfsg1-9	221.6 kB	2,635.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.2.10+dfsg1-9	274.2 kB	2,032.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.2.10+dfsg1-9	210.7 kB	2,030.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.2.10+dfsg1-9	222.1 kB	2,300.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.2.10+dfsg1-9	212.2 kB	10,340.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.2.10+dfsg1-9	208.3 kB	1,842.0 kB	[zoznam súborov]