[ ソース: velvet ]
パッケージ: velvet-long (1.2.10+dfsg1-9 など)
Nucleic acid sequence assembler for very short reads, long version
Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.
Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.
This package installs special long-mode versions of Velvet, as recommended in the Velvet tutorials.
その他の velvet-long 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: velvet
- 非常に短いリード用塩基配列アセンブラ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4 以外]
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]
velvet-long のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| alpha (非公式の移植版) | 1.2.10+dfsg1-9 | 245.2 kB | 2,955.0 kB | [ファイル一覧] |
| amd64 | 1.2.10+dfsg1-9 | 192.2 kB | 1,860.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 1.2.10+dfsg1-9 | 194.5 kB | 2,320.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 1.2.10+dfsg1-9 | 221.0 kB | 2,126.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 1.2.10+dfsg1-9 | 199.7 kB | 1,306.0 kB | [ファイル一覧] |
| hppa (非公式の移植版) | 1.2.10+dfsg1-9 | 250.2 kB | 2,422.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 1.2.10+dfsg1-9 | 227.8 kB | 2,365.0 kB | [ファイル一覧] |
| ia64 (非公式の移植版) | 1.2.10+dfsg1-8 | 328.5 kB | 5,411.0 kB | [ファイル一覧] |
| m68k (非公式の移植版) | 1.2.10+dfsg1-9 | 180.7 kB | 1,700.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 1.2.10+dfsg1-9 | 198.2 kB | 2,632.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64 (非公式の移植版) | 1.2.10+dfsg1-9 | 211.5 kB | 2,650.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 1.2.10+dfsg1-9 | 221.6 kB | 2,635.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 1.2.10+dfsg1-9 | 274.2 kB | 2,032.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 1.2.10+dfsg1-9 | 210.7 kB | 2,030.0 kB | [ファイル一覧] |
| sh4 (非公式の移植版) | 1.2.10+dfsg1-9 | 222.1 kB | 2,300.0 kB | [ファイル一覧] |
| sparc64 (非公式の移植版) | 1.2.10+dfsg1-9 | 212.2 kB | 10,340.0 kB | [ファイル一覧] |
| x32 (非公式の移植版) | 1.2.10+dfsg1-9 | 208.3 kB | 1,842.0 kB | [ファイル一覧] |