[ Fonte: ska ]
Pacote: ska (1.0+dfsg-4)
Links para ska
Recursos de Debian:
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- Informação de desenvolvedor(a)
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- Arquivo de copyright
- Rastreador de patch Debian
Baixe o pacote-fonte ska:
Mantenedores(as):
Fontes externas:
- Pagina principal [github.com]
Pacotes similares:
Split Kmer Analysis
SKA (Split Kmer Analysis) is a toolkit for prokaryotic (and any other small, haploid) DNA sequence analysis using split kmers. A split kmer is a pair of kmers in a DNA sequence that are separated by a single base. Split kmers allow rapid comparison and alignment of small genomes, and is particulalry suited for surveillance or outbreak investigation. SKA can produce split kmer files from fasta format assemblies or directly from fastq format read sequences, cluster them, align them with or without a reference sequence and provide various comparison and summary statistics. Currently all testing has been carried out on high-quality Illumina read data, so results for other platforms may vary.
Outros pacotes relacionados a ska
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- dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]
- GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]
- Biblioteca de suporte GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, loong64, mips64el, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Biblioteca de suporte GCC
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Biblioteca de suporte GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- Biblioteca C++ padrão da GNU v3
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- dep: libunwind8 [ia64]
- biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)
Download de ska
| Arquitetura | Tamanho do pacote | Tamanho instalado | Arquivos |
|---|---|---|---|
| alpha (porte não oficial) | 133.7 kB | 543.0 kB | [lista de arquivos] |
| amd64 | 143.9 kB | 451.0 kB | [lista de arquivos] |
| arm64 | 121.9 kB | 415.0 kB | [lista de arquivos] |
| armel | 119.9 kB | 394.0 kB | [lista de arquivos] |
| armhf | 124.9 kB | 314.0 kB | [lista de arquivos] |
| hppa (porte não oficial) | 138.9 kB | 436.0 kB | [lista de arquivos] |
| i386 | 149.6 kB | 482.0 kB | [lista de arquivos] |
| ia64 (porte não oficial) | 175.0 kB | 846.0 kB | [lista de arquivos] |
| loong64 (porte não oficial) | 125.6 kB | 431.0 kB | [lista de arquivos] |
| m68k (porte não oficial) | 117.8 kB | 422.0 kB | [lista de arquivos] |
| mips64el | 125.3 kB | 514.0 kB | [lista de arquivos] |
| ppc64 (porte não oficial) | 138.2 kB | 545.0 kB | [lista de arquivos] |
| ppc64el | 138.4 kB | 543.0 kB | [lista de arquivos] |
| riscv64 | 140.4 kB | 363.0 kB | [lista de arquivos] |
| s390x | 142.4 kB | 463.0 kB | [lista de arquivos] |
| sh4 (porte não oficial) | 148.8 kB | 414.0 kB | [lista de arquivos] |
| sparc64 (porte não oficial) | 118.6 kB | 1,122.0 kB | [lista de arquivos] |
| x32 (porte não oficial) | 138.5 kB | 426.0 kB | [lista de arquivos] |