Pacote: delly (1.1.8-1 e outros)

[ Fonte: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Outros pacotes relacionados a delly

• dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  set of date-time libraries based on generic programming concepts

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  biblioteca Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  biblioteca de sistema operacional (e.g. suporte a diagnósticos)

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  bib. de alta qualid. de compactação de arqs. bas. em ordenação de blocos - exec

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, loong64, mips64el, ppc64, riscv64, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  biblioteca de compressão para formato XZ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [não arm64, x32]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de delly

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.1.8-1+b3	367.2 kB	1,368.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.1.8-1+b2	394.0 kB	1,200.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.1.8-1+b3	355.5 kB	1,172.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.1.8-1+b2	318.5 kB	1,027.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.1.8-1+b2	329.8 kB	723.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.1.8-1+b2	379.8 kB	1,124.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.1.8-1+b2	419.1 kB	1,251.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.1.8-1+b2	506.4 kB	2,499.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.1.8-1+b2	354.3 kB	1,143.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.1.8-1+b2	370.6 kB	1,171.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.1.8-1+b2	354.5 kB	1,474.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.1.8-1+b2	387.6 kB	1,492.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.1.8-1+b2	386.6 kB	1,364.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.1.8-1+b2	382.7 kB	884.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.1.8-1+b2	399.0 kB	1,280.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.1.8-1+b2	468.4 kB	1,109.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.1.8-1+b2	323.6 kB	2,077.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.1.8-1+b3	412.7 kB	1,195.0 kB	[lista de arquivos]