Pacote: blasr (5.3.5+dfsg-7 e outros)

[ Fonte: blasr  ]

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Outros pacotes relacionados a blasr

• dep: libblasr [x32]

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg) [não hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [hppa, ppc64]

  dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64el]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [x32]

  Pacote não disponível

  dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sh4]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Pacote não disponível

• dep: libhdf5-10 [hppa, ppc64]

  Pacote não disponível

• dep: libhdf5-100 [x32]

  Pacote não disponível

• dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0) [x32]

  Pacote não disponível

• dep: libhdf5-cpp-103 (>= 1.10.1) [m68k, sh4]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version (transitional package)

• dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5) [ia64]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.15-patch1) [ppc64]

  Pacote não disponível

  dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.16) [hppa]

• dep: libhdf5-cpp-310 (>= 1.14.4.3) [não hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, x32]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libpbbam0.23.0 (>= 0.23.0+dfsg) [m68k, sh4]

  Pacote não disponível

• dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg) [não hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [não hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbdata [x32]

  tools for handling PacBio sequences

• dep: libpbihdf [x32]

  tools for handling PacBio hdf5 files

• dep: libpbseq [m68k, sh4]

  library for analyzing PacBio sequencing data

  dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~) [ia64]

  dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-9~) [não hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, x32]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [não hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [hppa, ppc64, x32]

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de blasr

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	5.3.5+dfsg-7+b1	226.4 kB	808.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	5.3.5+dfsg-7+b1	232.8 kB	700.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	5.3.5+dfsg-7+b1	201.7 kB	680.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1,423.6 kB	6,078.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	5.3.5+dfsg-6+b4	271.0 kB	1,226.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	5.3.5+dfsg-7+b1	210.5 kB	680.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	5.3.3+dfsg-1+b1	180.6 kB	591.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	5.3.5+dfsg-7+b1	214.9 kB	824.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	0~20150724+git3ca7fe8-1+b2	1,367.5 kB	6,824.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	5.3.5+dfsg-7+b1	226.1 kB	808.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	5.3.5+dfsg-7+b1	226.1 kB	532.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	5.3.3+dfsg-1+b1	223.0 kB	543.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	5.3-1+b1	459.5 kB	1,607.0 kB	[lista de arquivos]