Pacote: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-3 e outros) [non-free]

[ Fonte: cufflinks  ]

Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.

Etiquetas: Biologia: Ácidos nucleicos, Campo: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Função: Programa, Funciona com: Sequência biológica

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• enh: tophat

  fast splice junction mapper for RNA-Seq reads

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Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	2.2.1+dfsg.1-3+b1	1,467.3 kB	10,248.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2.2.1+dfsg.1-3+b1	1,365.4 kB	9,782.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	2.2.1+dfsg.1-3+b1	1,079.9 kB	6,034.0 kB	[lista de arquivos]
i386	2.2.1+dfsg.1-3+b1	1,494.9 kB	10,392.0 kB	[lista de arquivos]