[ ソース: cufflinks ]
パッケージ: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-3 など) [non-free]
cufflinks に関するリンク
Debian の資源:
cufflinks ソースパッケージをダウンロード:
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-3.dsc]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1.orig.tar.gz]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-3.debian.tar.xz]
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Alexandre Mestiashvili (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
- Charles Plessy (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [cufflinks.cbcb.umd.edu]
類似のパッケージ:
Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.
その他の cufflinks 関連パッケージ
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- dep: libboost-serialization1.67.0
- serialization library for C++
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- dep: libboost-system1.67.0
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
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- dep: libboost-thread1.67.0
- portable C++ multi-threading
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- dep: libc6 (>= 2.23)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:4.0) [amd64, armhf]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]
- dep: libgcc1 (>= 1:4.5) [arm64]
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- enh: tophat
- fast splice junction mapper for RNA-Seq reads