Package: boxshade (3.3.1-14)

[ Source: boxshade  ]

embelezador de impressão de alinhamentos de seqüência múltipla

Boxshade é um programa para criar saídas de impressão de boa aparência a partir de seqüências de proteínas múltiplas alinhadas ou DNA. O programa não executa o alinhamento sozinho e requer como entrada um arquivo que tenha sido criado por um programa de alinhamento múltiplo ou editado manualmente com as respectivas ferramentas.

Boxshade lê seqüências múltiplas alinhadas a partir de arquivos PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data e ESEE-save (limitado a um máximo de 150 seqüências com até 10000 elementos cada). Vários tipos de sombreados podem ser aplicados a resíduos idênticos/similares. A saída é escrita na tela ou em um arquivo nos seguintes formatos: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag, Text

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• sug: kalign

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  or clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

  or mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

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  perfis "hidden Markov models" para análise de seqüência de proteína

• sug: seaview

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	53.3 kB	187.0 kB	[list of files]