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パッケージ: boxshade (3.3.1-14)

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多重配列アライメントのプリティプリンティング

Boxshade はマルチプルアライメントされたタンパク質または DNA 配列のきれいな プリントアウトを生成するプログラムです。このプログラム自身はアライメントを 行いませんので、入力ファイルとして、マルチプルアライメントプログラムが作成 したか、または個々のツールで手動編集したファイルが必要です。

Boxshade はマルチプルアライメントされた配列を PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data および ESEE-save ファイルから読み込みます (最大 150 配列 まで、各配列は最大 10000 エレメントまでの制限があります) 。各種シェーディ ングを一致する/類似の残基に適用できます。出力は画面に表示するか、または以下の フォーマットによりファイルに出力できます: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ-250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, use::typesetting, サポート形式: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, 取り扱い対象: 追加のタグが必要, テキスト

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