Пакунок: boxshade (3.3.1-14)

[ Source: boxshade  ]

Красиві роздруківки декількох угрупувань послідовностей

Boxshade — це програма для створення „гарненьких“ роздруківок множинного вирівнювання послідовностей білка чи ДНК. Програма не виконує вирівнювання самостійно, а вимагає, щоб вхідний файл створювався програмою множинного вирівнювання або був відредагований вручну відповідними інструментами.

Boxshade читає багато разів вирівняні послідовності з файлів у форматах PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED та ESEE (максимум 150 послідовностей до 10000 елементів кожна). Для виділення ідентичних/подібних залишків можна використовувати різні види затінення. Результат виводиться на екран або у файл в наступних форматах: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-друкарка, ASCII, xFIG, PICT, HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag, Text

Інші пакунки пов'язані з boxshade

• dep: libc6 (>= 2.7)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• sug: kalign

  Global and progressive multiple sequence alignment

  or clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

  or mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

  or hmmer

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

• sug: xfig

  Facility for Interactive Generation of figures under X11

Завантажити boxshade

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
mips64el	53.3 kB	187.0 kB	[список файлів]