Pacote: dascrubber (1.1-2)

[ Fonte: dascrubber  ]

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Outros pacotes relacionados a dascrubber

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [não arm64, ppc64el]

• sug: daligner

  descoberta de alinhamento local entre longas leituras de sequenciamento de nucleotídeos

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Download de dascrubber

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	164.8 kB	1,185.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	142.4 kB	1,109.0 kB	[lista de arquivos]
armel	139.4 kB	1,139.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	137.6 kB	799.0 kB	[lista de arquivos]
i386	157.8 kB	1,327.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	135.9 kB	1,217.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	142.7 kB	1,279.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	165.9 kB	1,789.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	155.3 kB	1,237.0 kB	[lista de arquivos]