Paquet : daligner (1.0+git20200727.ed40ce5-3)

[ Paquet source : daligner  ]

alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide

Ces outils permettent de trouver tous les alignements locaux significatifs parmi des lectures encodées dans une base de données Dazzler. L’hypothèse est que les lectures sont originaires d’un séquenceur à lectures longues RS II de Pacific Biosciences. C'est-à-dire que les lectures sont longues et bruitées, jusqu’à 15 % en moyenne.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme

Autres paquets associés à daligner

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

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Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	200,3 ko	1 508,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	173,8 ko	1 408,0 ko	[liste des fichiers]
armel	168,3 ko	1 436,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	170,4 ko	1 024,0 ko	[liste des fichiers]
i386	192,0 ko	1 696,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	167,0 ko	1 575,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	174,3 ko	1 632,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	198,3 ko	2 188,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	188,9 ko	1 572,0 ko	[liste des fichiers]