Pakiet: macs (3.0.1-2)

[ Pakiet źródłowy: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Inne pakiety związane z macs

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-cykhash

  cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique

• dep: python3-hmmlearn

  unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models

• dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-scipy

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• dep: python3-sklearn

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie macs

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	4 425,1 KiB	14 386,0 KiB	[lista plików]
arm64	3 924,4 KiB	14 472,0 KiB	[lista plików]
armel	3 938,0 KiB	13 353,0 KiB	[lista plików]
armhf	4 036,1 KiB	10 033,0 KiB	[lista plików]
i386	4 419,1 KiB	15 630,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	4 251,0 KiB	17 997,0 KiB	[lista plików]
s390x	4 265,3 KiB	14 839,0 KiB	[lista plików]