Pakiet: daligner (1.0+git20240119.335105d-2)

[ Pakiet źródłowy: daligner  ]

Odkrywanie lokalnego dopasowania między odczytami długich sekwencji nukleotydowych

Narzędzia te umożliwiają znalezienie wszystkich istotnych lokalnych wyrównań między odczytami zakodowanymi w bazie danych Dazzler. Zakłada się, że odczyty pochodzą z sekwencera o długim czasie odczytu Pacific Biosciences RS II. Oznacza to, że odczyty są długie i zawierają dużo szumu, średnio do 15%.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: Program

Inne pakiety związane z daligner

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Pobieranie daligner

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	235,7 KiB	1 626,0 KiB	[lista plików]
arm64	206,7 KiB	1 928,0 KiB	[lista plików]
armel	198,1 KiB	1 520,0 KiB	[lista plików]
armhf	198,1 KiB	1 128,0 KiB	[lista plików]
i386	227,8 KiB	1 756,0 KiB	[lista plików]
mips64el	195,6 KiB	2 039,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	231,2 KiB	2 186,0 KiB	[lista plików]
riscv64	225,9 KiB	1 238,0 KiB	[lista plików]
s390x	240,1 KiB	1 788,0 KiB	[lista plików]