Balík: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 a iné)

[ Zdroj: daligner  ]

objavovanie lokálneho zarovnania medzi dlhými čítaniami postupností nukleotidov

Tieto nástroje umožňujú nájsť všetky významné lokálne zarovnania medzi čítaniami zakódovanými v databáze Dazzler. Predpokladom je, že čítania sú zo sekvencéra dlhých čítaní Pacific Biosciences RS II. To znamená, že čítania sú dlhé a obsahujú veľa šumu, v priemere 15 %.

Značky: Implementované v: C, User Interface: Príkazový riadok, Role: Program

Ostatné balíky súvisiace s balíkom daligner

• dep: libc6 (>= 2.38)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Stiahnuť daligner

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236.0 kB	1,626.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208.1 kB	1,931.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198.3 kB	1,520.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198.1 kB	1,128.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227.6 kB	1,756.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195.5 kB	2,039.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231.4 kB	2,186.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226.8 kB	1,238.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240.3 kB	1,788.0 kB	[zoznam súborov]